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PikoGreen 核酸荧光染料,荧光染料在科研中的特异性

2025-08-28

PikoGreen 核酸荧光染料 是荧光检测 dsDNA 并进行定量的一种产品,这种方法非常灵敏。常用于分子生物学技术中 cDNA 文库的构建、亚克隆的 DNA 片段纯化及应用,比如进行 DNA 定量、产物扩增和引物的进一步检测。

常规的 DNA 含量的检测方法是在 260 nm 处测其吸光值,主要缺点是核苷酸、单链核酸和蛋白质对信号的影响很大,并且还会受到核酸制备过程中污染物 的干扰,无法区分 DNA 和 RNA,而且这种方法不灵敏(5 μg/mL dsDNA 溶液 A260 = 0.1)。PikoGreen 核酸荧光染料 只有与 dsDNA 结合后才发出荧光,并且所发荧光强度与 DNA 浓度成正比。PikoGreen 核酸荧光染料可以检测出 25 pg/mL~1000 ng/mL 范围内的 dsDNA, 且线性关系较好 (R2 > 0.99)。对于总体积为 200 μL 的检测体系,1 mL 规格可检测 2000 个样本。

PikoGreen 核酸荧光染料的特异性主要体现在对双链 DNA(dsDNA)的高度选择性结合,具体表现如下:

1. 仅与 dsDNA 结合发光,对其他核酸形式低响应

  • 对 ssDNA 和 RNA 的特异性抑制:
    当与单链 DNA(ssDNA)或 RNA 结合时,PikoGreen 的荧光强度极低(几乎不发光)。例如,在等摩尔浓度的 RNA 存在时,其对 dsDNA 的结合特异性显著,仅识别 dsDNA 的双螺旋结构,而不会被单链核酸干扰。

  • 不受单体核苷酸影响:
    游离的核苷酸(如 dNTP、NTP)无法激活 PikoGreen 的荧光,避免了核酸降解产物或反应体系中残留核苷酸的干扰。

2. 无序列依赖性,适配多种 dsDNA 结构

  • 不依赖碱基序列或 GC 含量:
    无论 dsDNA 的碱基组成(如 AT/GC 比例)或序列如何,PikoGreen 均能以相似的效率结合,保证了不同来源 DNA(如基因组 DNA、PCR 产物、质粒等)定量的一致性。

  • 兼容不同长度的 dsDNA:
    从短链寡核苷酸(如 10 bp 以上)到长链基因组 DNA,均可被特异性识别,适用范围广泛。

3. 抗常见污染物干扰,维持特异性结合

  • 耐受反应体系中的杂质:
    对盐(如 NaCl)、尿素、乙醇、氯仿、去垢剂(如 SDS)、蛋白质(如 BSA)或琼脂糖等常见污染物具有较高耐受性。例如,在 PCR 产物直接定量时,无需纯化即可排除反应体系中引物、dNTP 等杂质的影响,确保仅针对 dsDNA 的特异性检测。

PikoGreen 的高特异性使其在以下场景中表现突出:

  • 复杂样品中 dsDNA 的精准定量:如血清、细胞裂解液、环境样本等含有多种核酸或杂质的体系。

  • PCR 产物直接检测:无需纯化即可排除引物二聚体(单链或短双链结构)的干扰,仅定量目标 dsDNA 产物。

  • 区分 dsDNA 与其他核酸形式:例如在 RNA 提取实验中,可特异性检测残留的 dsDNA 污染。

这种 “仅识别 dsDNA 双螺旋结构” 的特性,使其成为核酸定量中可靠性较高的工具。

本文引用地址:https://www.med-life.cn/product/1296387.html

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