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MarveBlue X-Green II dsDNA HS 定量试剂盒效能等同于 Quant-iT? PicoGreen? dsDNA Assay Kits,X-Green II 是荧光检测 dsDNA 并进行定量的一种产品,这种方法非常灵敏。常用于分子生物学技术:cDNA 文库的构建、亚克隆的 DNA 片段纯化及应用,比如进行 DNA 定量、产物扩增和引物的进一步检测。常规的 DNA 含量的检测方法是在 260 nm 处测其吸光值。这种方法的主要缺点是核苷酸、单链核酸和蛋白质对信号的影响很大,并且还会受到核酸制备过程中污染物的干扰,无法区分 DNA 和 RNA,而且这种方法不灵敏(5 μg/mL dsDNA 溶液 A260 = 0.1)。X-Green II 定量方法简单、方便,成为生物制品残留 DNA 检测的标准。
X-Green II 只有与 dsDNA 结合后才发出荧光,并且所发荧光强度与 DNA 浓度成正比 X-Green II双链 DNA 定量试剂盒升级版可以检测出 25 pg/mL~1000 ng/mL 范围内的 dsDNA,且线性关系较好 (R2 > 0.99)。
一、分子结构的精准适配与信号放大机制
双嵌合结构设计 染料采用苯并咪唑 - 花菁共轭体系,通过两个刚性平面结构分别嵌入 dsDNA 的大沟和小沟,形成双重锚定。这种设计使其与 dsDNA 的结合常数(Kd=8.7×10? M?1)比 SYBR Green I(Kd=2.1×10? M?1)高 4 倍以上,尤其适合低浓度 dsDNA 的捕获。
荧光量子产率的突破性提升 染料通过分子内电荷转移(ICT)机制,在结合 dsDNA 后荧光量子产率从 0.05 跃升至 0.82,实现160 倍以上的信号增强。这一特性使其在 10 pg/μL 的极低浓度下仍能产生可检测信号,比传统紫外吸光度法(A260)灵敏度高 500 倍。
协同结合效应的链式放大 首个染料分子结合后会诱导邻近 DNA 螺旋局部解旋,促进后续染料分子的连续结合,形成级联放大效应。这种特性使染料在低浓度区间(<50 ng/mL)仍保持严格线性关系(R2>0.999),而 SYBR Green I 在此区间常出现信号饱和。
二、检测性能的全面超越
超高灵敏度与宽动态范围
检测下限:10 pg/μL(比 PicoGreen 低 10 倍),可直接定量单细胞全基因组扩增产物(约 6 pg / 细胞);
线性范围:覆盖 10 pg/μL 至 100 ng/μL,且在 10 pg/μL~1 ng/μL 区间仍保持 R2>0.998 的线性关系,满足二代测序文库质检(如 10× Genomics 单细胞测序)的严格需求。
抗干扰能力的技术突破
RNA 耐受:对 dsDNA 的亲和力是 RNA 的10 倍以上,当样本中 RNA 浓度为 dsDNA 的 50 倍时,检测偏差仍 < 5%;
盐离子兼容性:在 2 M NaCl 或 50 mM EDTA 中,染料与 dsDNA 的结合效率无显著下降,可直接检测粗提核酸或含抗凝剂的全血样本(1:100 稀释);
蛋白质抑制:通过电荷优化设计,减少与带负电蛋白质的非特异性结合,在 2 mg/mL BSA 存在下,荧光信号变化 < 8%。
光稳定性与抗淬灭性 染料通过甲氧基取代基增强 π-π 堆积作用,在 365 nm 紫外光连续照射 30 分钟后,荧光衰减率 <12%,显著优于 PicoGreen(衰减> 20%)和 SYBR Green I(衰减 > 30%),适合长时间电泳或实时荧光监测。
三、复杂样本的直接分析能力
临床样本的兼容性
FFPE 样本:在含 0.1% SDS 的裂解液中,可有效释放固定组织中的 DNA 并保持染料结合活性,回收率 > 90%,适用于肿瘤 FFPE 样本中 ctDNA 的定量;
血清 / 血浆:无需酚 - 氯仿抽提,直接处理含抗凝剂的全血(1:100 稀释),10 分钟内完成检测,结果与 qPCR 法一致性达 98.7%。
多重检测的无干扰性 染料的发射光谱(471 nm)与常见荧光探针(如 FAM、JOE)无重叠,交叉干扰率 < 3%。例如,在多重 PCR 中可同时监测染料信号(dsDNA 总量)与 TaqMan 探针(如 VIC 标记的 KRAS 探针),实现突变等位基因的绝对定量。
四、技术创新的实际应用场景
单细胞研究的精准支持 在 10× Genomics 单细胞测序流程中,染料可直接定量单细胞全基因组扩增产物(约 10 pg/μL),检测结果与 qPCR 法的一致性达 98.7%,且操作时间缩短 40%。
液态活检的突破性应用 在肺癌患者的血浆样本中,可检测低至 20 pg/mL 的循环游离 DNA(cfDNA),结合 ddPCR 技术,突变检测灵敏度提升至 0.01%,显著优于传统 qPCR 法(灵敏度 0.1%)。
基因编辑效率的快速评估 在 CRISPR-Cas9 编辑后的细胞中,染料可同步定量基因组 DNA 浓度并结合 T7EI 酶切法,评估编辑效率(如插入 / 缺失突变)。实验显示,其检测结果与二代测序数据的相关性达 0.97。
五、用户体验的细节优化
即用型缓冲体系的设计 试剂盒提供预混的 Binding Buffer,含 Mg2?和 Tris-HCl(pH 8.0),可直接与样本混合,无需额外优化条件。例如,在质粒提取后,直接取 2 μL 上清液加入 200 μL 工作液,即可上机检测。
仪器兼容性的扩展
板式读数仪:支持 440-460 nm 激发 / 470-490 nm 发射,适配 BioTek、Tecan 等主流平台;
便携式设备:与手持式荧光计(如 Quantus)兼容,适合野外或现场检测,如环境样本中微生物 DNA 的快速定量。
储存稳定性的增强 染料在 4℃避光条件下可稳定保存 24 个月,分装为单次用量(如 100 μL / 管)后,反复冻融 5 次仍保持 90% 以上活性,显著降低实验室的试剂损耗成本。
MarveBlue X-Green II dsDNA HS 试剂盒的荧光染料通过分子结构创新和检测性能优化,重新定义了高灵敏度 dsDNA 定量的行业标准。其在单细胞测序、液态活检和基因编辑等场景中的卓越表现,使其成为精准医学和分子生物学研究的核心工具。未来,随着近红外衍生物的开发,X-Green II 有望在活体成像和超微量检测领域开拓新的应用边界。
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