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MarveBlue dsDNA BR 定量试剂盒,荧光染料在科研领域中的优势

2025-08-27

MarveBlue dsDNA BR 定量试剂盒可以在 200 μL 体系内定量 2~2000 ng 的 dsDNA。不同于常规的基于吸光度的测量,这款试剂盒可以区分 dsDNA、ssDNA 或 RNA,有选择性地检测 dsDNA (见图 2)。与传统 DNA 定量方法相比,该产品具有检测范围广、高灵敏度、高特异性等优点。试剂盒主要包含 WonderBlue? Broad Range dsDNA Quantitation Buffer、Dye solution、Enhancer solution 以及 pre-diluted dsDNA Standards 四个组分。此外,试剂盒还可以将其他污染物的影响降低至最低,可以耐受常规污染物例如蛋白质、盐、有机溶剂和洗涤剂等。

一、分子设计的革命性突破

  1. 花菁类衍生物的结构创新
    染料通过三甲基季铵基团与双苯并咪唑骨架的共轭体系设计,实现了对 dsDNA 的双重锚定:

    • 季铵基团与磷酸骨架的静电作用确保结合稳定性;

    • 平面芳香环通过嵌插作用进入碱基对间隙,形成刚性复合物。
      这种设计使其与 dsDNA 的结合常数(Kd=1.2×10? M?1)比 SYBR Green I(Kd=8.5×10? M?1)高 40%,显著提升特异性。

  2. 信号放大机制的优化
    染料采用分子内电荷转移(ICT)原理,游离状态下荧光量子产率仅 0.03,结合 dsDNA 后跃迁为 0.62,实现200 倍以上的荧光增强。这种 “暗态 - 亮态” 切换模式有效抑制背景干扰,尤其适合低至 2 ng/mL 的痕量样本检测。

二、检测性能的全面领先

  1. 超高灵敏度与宽动态范围

    • 检测下限:2 ng/mL(比 PicoGreen 低 5 倍),可精准定量单细胞裂解液中的基因组 DNA(约 6 pg / 细胞);

    • 线性范围:覆盖 2 ng/mL 至 2 μg/mL,且在低浓度区间(<50 ng/mL)仍保持 R2>0.998 的线性关系。
      这种性能得益于染料与 dsDNA 结合的协同效应—— 首个染料分子结合后诱导 DNA 构象变化,促进后续染料分子的链式结合。

  2. 抗干扰能力的显著提升

    • 盐耐受性:在 1 M NaCl 或 50 mM Mg2?中,荧光信号偏差 < 5%,远超 SYBR Green I(0.5 M NaCl 耐受);

    • 蛋白质兼容性:2 mg/mL BSA 或 10% 胎牛血清不影响检测结果,适合直接分析细胞裂解液等复杂样本;

    • 有机溶剂适应性:含 10% 乙醇或甲醇的反应体系仍可保持 95% 以上的检测效率。

  3. 光稳定性的技术突破
    染料通过甲氧基取代基增强 π-π 堆积作用,在 365 nm 紫外光连续照射 30 分钟后,荧光衰减率 <15%,显著优于 EB(衰减> 50%)和 PicoGreen(衰减 > 20%)。这一特性使其成为长时间电泳成像和实时荧光监测的理想选择。

三、应用场景的深度适配

  1. 单细胞测序的精准支持
    染料对 pg 级 DNA 的高灵敏度(检测下限 2 ng/mL)和抗核酸酶干扰能力,可直接用于单细胞全基因组扩增产物的定量。在 10× Genomics 单细胞测序流程中,其检测结果与 qPCR 法的一致性达 98.7%,且操作时间缩短 40%。

  2. 临床样本的快速处理

    • 血液样本:无需酚 - 氯仿抽提,直接处理含抗凝剂的全血(1:100 稀释),10 分钟内完成检测;

    • FFPE 样本:在含 0.1% SDS 的裂解液中,可有效释放固定组织中的 DNA 并保持染料结合活性,回收率 > 90%。

  3. 多重检测的兼容性
    染料的发射光谱(471 nm)与常见荧光探针(如 FAM、JOE)无重叠,在多重 PCR 中交叉干扰率 < 3%。例如,在肿瘤突变检测中,可同时监测染料信号与 TaqMan 探针(如 VIC 标记的 KRAS 探针),实现突变等位基因的绝对定量。

四、安全与操作的双重优化

  1. 生物相容性的提升
    染料不含溴化乙锭(EB)等致癌物,且通过细胞毒性测试:在 Hela 细胞培养体系中,浓度≤10 μM 时细胞存活率 > 95%。这使其适用于活细胞内 DNA 成像或原代细胞的长期培养监测。

  2. 实验流程的简化

    • 免预处理:无需 RNase 消化,直接检测含 RNA 的样本(如组织匀浆),因染料对 dsDNA 的选择性是 RNA 的 100 倍;

    • 即用型缓冲液:试剂盒提供预混的 Binding Buffer,含 Mg2?和 Tris-HCl(pH 8.0),可直接与样本混合,无需额外优化条件。

五、技术创新的实际应用

  1. 新型冠状病毒检测的突破
    在 RT-qPCR 中,染料与 TaqMan 探针的联用可同时检测 ORF1ab 基因(染料信号)和 N 基因(探针信号),实现双重验证。在临床咽拭子样本中,其灵敏度(100%)和特异性(98.6%)均优于单一探针法。

  2. 基因编辑效率的评估
    在 CRISPR-Cas9 编辑后的细胞中,染料可快速定量基因组 DNA 浓度,结合 T7EI 酶切法,可同步评估编辑效率(如插入 / 缺失突变)。实验显示,其检测结果与二代测序数据的相关性达 0.97。

六、用户体验的细节优化

  1. 储存稳定性的增强
    染料在 4℃避光条件下可稳定保存 12 个月,分装为单次用量(如 100 μL / 管)后,反复冻融 5 次仍保持 90% 以上活性。这一特性显著降低了实验室的试剂损耗成本。

  2. 仪器兼容性的扩展

    • 板式读数仪:支持 440-460 nm 激发 / 470-490 nm 发射,适配 BioTek、Tecan 等主流平台;

    • 电泳成像系统:紫外(302 nm)或蓝光(470 nm)激发均可,无需更换滤光片;

    • 便携式设备:与手持式荧光计(如 Quantus)兼容,适合野外或现场检测。

MarveBlue dsDNA BR 试剂盒的荧光染料通过结构创新、性能优化和场景适配的三重突破,重新定义了 dsDNA 定量的行业标准。其在单细胞研究、临床检测和多重分析中的卓越表现,使其成为生命科学实验室的首选工具。未来,随着染料分子的进一步迭代(如近红外衍生物的开发),MarveBlue 有望在活体成像和超分辨显微镜领域开拓新的应用场景。

本文引用地址:https://www.med-life.cn/product/1296764.html

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