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SYBR Green qPCR Master Mix (2×) 是一种结合于所有 dsDNA 双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。SYBR Green qPCR Master Mix (2×) 与 dsDNA 结合荧光信号会增强 800~1000 倍,是一种常用的 qPCR 荧光染料。具有高灵敏度,信噪比高等优势,可应用于基因表达差异分析,基因芯片等。
一、按需释放机制:高灵敏度与低抑制性的完美平衡
EvaGreen 通过二聚体结构与构象转换机制实现 DNA 结合。在无 DNA 时,染料呈闭合环状无荧光状态;当遇到双链 DNA(dsDNA)时,构象转为开放线性并嵌入 DNA 小沟,释放强烈荧光。这种 “按需释放” 特性带来两大突破:
高浓度使用不抑制 PCR:可在饱和浓度下工作(远超 SYBR Green I 的使用浓度),显著增强信号强度,同时避免因染料不足导致的 “重分布” 现象(即染料从短片段迁移至长片段,干扰熔解曲线分析)。
兼容快速 PCR:对 Taq 酶活性抑制极低,支持缩短延伸时间(如 30 秒→10 秒),在保证扩增效率的同时,将 qPCR 总时长缩短 30% 以上。
二、HRM 分析的黄金搭档:单碱基差异的精准捕捉
在 HRM 实验中,EvaGreen 的饱和染色特性使其成为区分序列细微差异的利器:
单碱基突变检测:通过熔解曲线的形状和温度变化,可精准识别 SNP、插入 / 缺失突变及甲基化差异。
线粒体 DNA 直接定量:无需核基因参照即可定量线粒体 DNA,减少因内参选择引入的误差,特别适用于线粒体疾病研究。
复杂样本适应性:对富含 GC 的模板(如某些病毒基因组)或含抑制剂的临床样本(如血液、组织裂解液)仍能保持高分辨率,避免非特异性信号干扰。
三、稳定性与安全性:实验室操作的双重保障
化学稳定性卓越:在室温下可长期储存,反复冻融 20 次以上仍保持性能稳定;高温(95°C)处理 48 小时无降解,远优于易分解的 SYBR Green I。
生物安全性突出:细胞膜穿透性极弱,且经 Ames 实验验证无诱变性和细胞毒性,显著降低实验人员暴露风险。相比之下,SYBR Green I 具有较强的细胞膜渗透性,可能干扰细胞内 DNA 修复机制,甚至被列为环境污染物。
四、兼容性与多功能性:无缝融入现有实验体系
仪器通用性:激发 / 发射光谱(约 500 nm/530 nm)与 SYBR Green I 完全一致,无需调整 qPCR 仪的光学参数即可直接替换,兼容 Roche LightCycler 480、Bio-Rad CFX 等主流设备。
多场景应用拓展:除 HRM 和 qPCR 外,EvaGreen 还可用于数字 PCR(ddPCR)、等温扩增(如 LAMP)、毛细管凝胶电泳等,且 PCR 产物可直接电泳检测(无需额外染色)。例如,其在 ddPCR 中表现出低背景荧光和高信噪比,支持对痕量 DNA 的绝对定量。
五、实验效率与结果可靠性的全面提升
预混体系简化流程:SatGreen Master Mix 已包含 EvaGreen 染料、热启动酶、缓冲液等成分,只需加入引物和模板即可反应,减少移液步骤和污染风险。
质控实时化:荧光信号随 PCR 进程动态变化,可实时监测扩增效率,及时发现模板降解或引物二聚体等问题,避免后续实验资源浪费。
数据重复性优异:优化的缓冲体系和染料稳定性,使不同批次实验的 Ct 值变异系数(CV)低于 5%,熔解曲线的 Tm 值差异小于 0.2°C。
实际应用场景与科研价值
基因分型与突变筛查:在肿瘤突变检测、遗传病诊断中,EvaGreen 可快速筛选未知突变,结合二代测序进一步验证。
药物研发与耐药性分析:通过 HRM 监测病原体耐药相关基因突变,助力抗生素敏感性评估。
表观遗传学研究:甲基化特异性 PCR(MSP)后直接进行熔解曲线分析,简化甲基化状态判断流程。
综上,EvaGreen 荧光染料凭借其饱和染色机制、高分辨率、稳定性和安全性,成为 HRM 分析的标杆性染料。SatGreen Master Mix 与之结合,不仅实现了实验流程的高效整合,更通过精准的熔解曲线分析和可靠的数据输出,为基因研究、分子诊断等领域提供了强大工具。
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